Khoa nghiên cứu Đài Loan và khu vực có tiền thân từ Viện nghiên cứu địa phương ( chỉ đào tạo Thạc sĩ - M.A)(thành lập năm 1999), sau đó được phát triển thành Khoa nghiên cứu địa phương (bậc đào tạo gồm Cử nhân và Thạc sĩ). Từ năm 2006, Khoa bắt đầu mở trình đào tạo thạc sỹ vào mùa hè và đến năm 2009 thì chính thức cung cấp các khóa đào tạo thạc sỹ. Ngày 1/8/2010, cùng với sự sát nhập của Đại học Quốc gia Đông Hoa (2008) và sự thay đổi cơ cấu của các viện nghiên cứu thành viên, với mong muốn mở rộng và chuyên sâu hơn về nghiên cứu chuyên ngành, Khoa Nghiên cứu Đài Loan và Khu vực (đào cử nhân và thạc sỹ).
Chương trình đào tạo của Khoa tập trung vào ba khía cạnh sau đây:

1. Liên kết nghiên cứu Đài Loan học và nghiên cứu Khu vực học ( ví dụ: Khu vực Châu Á – Thái Bình Dương/ Đông Nam Á)
2. Kết hợp giữa nghiên cứu điền dã và nghiên cứu tư liệu văn hiến.
3. Ứng dụng hệ thống GIS để nghiên cứu lĩnh vực Khoa học xã hội và Nhân văn. 

Văn bằng do Khoa cấp:

Cử nhân Khoa học xã hội và nhân văn (B.A)

Thạc sỹ khoa học xã hội và nhân văn